“数理论坛”第135期：Inference of pseudotime trajectory and regulatory network from single-cell data

报告题目

Inference of pseudotime trajectory and regulatory network from single-cell data

报告时间

2019年12月26日（周四）上午10:00—11:30

报告地点

东区综合楼A座1304室

报告人

田天海 教授（澳大利亚Monash大学）

报告人

简介

田天海教授2001年在澳大利亚昆士兰大学取得博士学位，博士毕业后在澳大利亚昆士兰大学，英国格拉斯哥大学，澳大利亚莫那什大学等一流大学工作。现在是莫那什大学数学学院教授。在基因网络和细胞信号传导等生物系统的随机建模，随机动力系统的数值模拟，模型参数估计，和统计分析与计算等方向开展过很多有创新意义的工作，并取得了较多的研究成果，获得过澳大利亚研究基金会的“未来研究员”（Future Fellow）和“澳大利亚研究员”(Australian Fellow)以及格拉斯哥大学“凯尔文爵士研究员”(Lord Kelvin Fellow)等称号。其研究成果己发表在高级别的学术刊物上，包括“自然杂志细胞生物学分刊”，“美国国家科学院会刊”和“当代生物学”等杂志。

报告摘要

One of the major challenges in single cell data analysis is the development of various computational methods to determine the pseudo time trajectories. Although substantial research studies have been conducted in recent years, more effective methods are still strongly required to calculate the pseudo time distance accurately and determine trajectories with multiple branches.

This talk will discuss two algorithms for the inference of pseudo-temporal trajectories with multiple branches. The effectiveness of the proposed method is examined by two single cell datasets.

邀请人

易鸣 教授

2019年 12月 20日